Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrip1Q8CBD1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms