Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxo48Q8CAT8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms