Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hdac7Q8C2B3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Hdac7Q8C2B3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac7Q8C2B3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac7Q8C2B3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Hdac7Q8C2B3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hdac7Q8C2B3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hdac7Q8C2B3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hdac7Q8C2B3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hdac7Q8C2B3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hdac7Q8C2B3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hdac7Q8C2B3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac7Q8C2B3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms