Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8C1R3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8C1R3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms