Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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