Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pdcl3Q8BVF2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms