Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubr7Q8BU04 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubr7Q8BU04 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms