Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU6

Slc18a2, Synaptic vesicular amine transporter, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a2Q8BRU6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc18a2Q8BRU6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc18a2Q8BRU6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc18a2Q8BRU6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc18a2Q8BRU6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Slc18a2Q8BRU6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Slc18a2Q8BRU6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18a2Q8BRU6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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