Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc2Q8BKV1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms