Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup93Q8BJ71 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms