Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms