Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Best2Q8BGM5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms