Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms