Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc50Q810U5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms