Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc172Q810N9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc172Q810N9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms