Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg2bQ80XK6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms