Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrde2Q80XC6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms