Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AknaQ80VW7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms