Protein–RNA interactions for Protein: Q80UQ2

Rassf6, Ras association domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf6Q80UQ2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf6Q80UQ2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms