Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NischQ80TM9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NischQ80TM9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms