Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms