Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ClmQ7TSN2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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