Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IfnkQ7TSL0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
IfnkQ7TSL0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms