Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms