Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Actn1Q7TPR4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms