Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf139Q7TMV1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf139Q7TMV1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms