Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcg2Q7TMS5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms