Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Uhrf2Q7TMI3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms