Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim12Q78RX3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms