Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stambpl1Q76N33 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms