Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rph3alQ768S4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms