Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cspg5Q71M36 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cspg5Q71M36 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cspg5Q71M36 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cspg5Q71M36 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cspg5Q71M36 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cspg5Q71M36 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cspg5Q71M36 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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