Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme8Q715T0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme8Q715T0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms