Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SynmQ70IV5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynmQ70IV5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms