Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SpopQ6ZWS8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SpopQ6ZWS8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms