Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RfflQ6ZQM0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RfflQ6ZQM0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RfflQ6ZQM0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RfflQ6ZQM0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RfflQ6ZQM0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfflQ6ZQM0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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