Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc44a1Q6X893 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc44a1Q6X893 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms