Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b3Q6UQ17 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b3Q6UQ17 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms