Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja6Q6S5G4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms