Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad54bQ6PFE3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms