Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms