Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc85bQ6PDY0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms