Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Papd7Q6PB75 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms