Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAN7

Prr18, Proline-rich protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr18Q6PAN7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr18Q6PAN7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr18Q6PAN7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr18Q6PAN7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr18Q6PAN7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr18Q6PAN7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr18Q6PAN7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr18Q6PAN7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr18Q6PAN7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr18Q6PAN7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr18Q6PAN7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr18Q6PAN7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr18Q6PAN7 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms