Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smchd1Q6P5D8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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