Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp12Q6P5B0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp12Q6P5B0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms