Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Podnl1Q6P3Y9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms