Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpbp1Q6NXH3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpbp1Q6NXH3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms