Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SphkapQ6NSW3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SphkapQ6NSW3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms