Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KdsrQ6GV12 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KdsrQ6GV12 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KdsrQ6GV12 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KdsrQ6GV12 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KdsrQ6GV12 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KdsrQ6GV12 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms